企業申請質量管理體系認證的流程一般如下：

前期準備：

建立質量管理體系：企業需依據 ISO 9001 標準要求，建立文件化的質量管理體系，并運行三個月以上。體系應涵蓋質量方針、目標，以及產品實現、資源管理、測量分析與改進等過程。

進行內部審核與管理評審：至少開展過一次內部質量管理體系內審與管理評審。內審需覆蓋所有場所和標準條款，以確保體系的有效性和符合性，管理評審則由最高管理者對體系的適宜性、充分性和有效性進行綜合評價。

準備相關材料：包括質量手冊、程序文件、企業簡介、組織機構圖、產品目錄、生產工藝流程圖（如有）、法律法規清單等。

提交認證申請：

選擇認證機構：企業可通過網絡搜索、行業推薦或咨詢機構建議等方式，選擇具有良好信譽和資質的認證機構。

填寫申請表：向認證機構提交《質量管理體系認證申請表》及相關附件，如營業執照復印件、資質證明（若有）等。

申請評審：認證機構對申請材料進行評審，審查內容包括填報信息的完整性、正確性，以及質量手冊是否覆蓋標準要求等。符合要求的，認證機構發出 “接受申請通知書”，并通知后續工作安排及預交認證費用；不符合要求的，要求企業補充或修改材料。

第一階段審核（文件審核）：

送交體系文件：企業將正式發布的質量管理體系手冊、程序文件送交認證機構。

文件審查：審核組長對文件進行審查，重點關注文件的符合性和完整性，以及與標準的契合度。

結果反饋與整改：如有不符合處，認證機構書面告知企業，企業進行修改直至滿足要求。

第二階段審核（現場審核）：

審核計劃安排：認證機構確定現場審核時間，組成審核組，并將審核計劃提前通知企業。

現場審核實施：審核組依據認證標準，對企業的質量管理體系進行全面審核，包括各部門的運作情況、生產現場的管理、文件執行情況等。審核以抽樣方式進行，通過查閱文件記錄、與員工交談、觀察現場操作等收集證據。

開具不符合項：審核組對發現的問題開具不符合項報告，明確不符合的事實、依據標準條款以及整改要求。

審核報告編寫：現場審核結束后，審核組編寫審核報告，包括審核概況、發現的問題、審核結論等，并提交認證機構。

問題整改：

企業制定整改計劃：針對不符合項，企業分析原因，制定詳細的整改計劃，明確責任人和整改期限。

實施整改措施：企業按照整改計劃落實整改措施，對相關文件進行修訂、對員工進行培訓、改進生產過程等。

提交整改證據：完成整改后，企業向認證機構提交整改證據，如修訂后的文件、培訓記錄、改進后的現場照片等。

審批與注冊發證：

認證機構審查：認證機構對審核報告、整改證據等進行全面審查。

作出認證決定：經審查，符合認證要求的，認證機構予以注冊并頒發注冊證書；需改進后才能通過認證的，書面通知企業需糾正的問題及完成期限，到期復查合格后再發證；不符合認證要求的，書面通知企業并說明理由。

獲證后監督管理：

監督審核：在證書有效期內，認證機構通常每年進行一次監督審核，以確保企業質量管理體系持續有效運行。監督審核流程與初次審核類似，但重點關注企業對上次審核不符合項的整改情況、體系的變更以及持續改進情況等。

證書維護：企業需按時繳納監督審核費用，配合認證機構的監督審核工作，保持體系的有效運行，以維持證書的有效性。

復評認證：證書有效期屆滿前，企業應提前申請復評認證，復評流程與初次認證基本一致。通過復評后，認證機構換發新證書。